Transport of terrestrial organic matter in the Ogooué deep sea turbidite system (Gabon)
(Marine and Petroleum Geology. vol. 28, n° 0264-8172, pp. 1061-1072, 12/04/2026)
EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS, iSTeP, UPMC, CNRS, SHOM
Hydrological processes affecting the subtropical NE Atlantic (34-38° N) over the last 30 ka: Evidence from phyto- and zooplankton assemblages
New dinocyst analyses were conducted on core MD99-2339 retrieved from the central Gulf of Cadiz. Dinocyst and foraminiferal assemblages from this core are combined with existing data off SW Portugal and NW Morocco to investigate past hydrological and primary productivity regimes in the subtropical NE Atlantic Ocean over the last 30 ka. Our results have revealed highest upwelling intensity during Heinrich Stadial 1 (HS 1) and the Younger Dryas and weaker upwelling cells during the Last Glacial Maximum and HS 2, off the SW Iberian and NW Moroccan margins. Similar assemblages between Cadiz and Morocco and distinct species off Portugal were observed during the cold climatic extremes that punctuated the last 30 ka. This pattern has been linked to the occurrence of a hydrological structure between SW Iberia and Cadiz during the last glacial period, probably similar to the modern Azores Front. This front was probably responsible locally for heterotrophic dinocysts found in the Gulf of Cadiz during the last glacial period, even if this sector is not conductive to upwelling phenomena by Ekman transport. Regional reconstructions of paleo-sea-surface temperatures using dinocyst and foraminiferal transfer functions, as well as alkenones, are also discussed and depict coherent scenarios over the last 30 ka. However, some mismatches are observed between the different quantitative reconstructions such as during HS 1 in the Gulf of Cadiz and during the LGM at the three core locations. © 2011 Author(s).
(pp. 2281-2327, 12/04/2026)
LDO, INSU - CNRS, UBO EPE, CNRS, EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS, LSCE, UVSQ, INSU - CNRS, CNRS, DRF (CEA), CEA
Bio-évaluation de la qualité écologique des rivières de l'île de la Réunion à partir des diatomées : Guide taxonomique
L'Indice Diatomique Réunion (IDR) est un nouvel outil de bioindication mis en place pour l'évaluation de la qualité biologique des cours d'eau de l'île de la Réunion à partir de la composition spécifique des communautés locales de diatomées benthiques. Cet outil a été développé conjointement par Asconit et l'Irstea, dans le cadre d'un programme initial de Recherche-Développement mis en ½uvre de 2008 à 2011 par l'Office de l'Eau et la DEAL de la Réunion, avec une contribution financière de l'Union Européenne (FEDER) et de l'ONEMA. L'objectif poursuivi était de doter la Réunion d'un outil diatomique adapté aux conditions biogéographiques locales et pouvant servir à l'Evaluation d'Etat Ecologique telle que recommandée par la DCE, celle-ci étant entrée en vigueur depuis 2005 sur le territoire français métropolitain, mais ayant aussi vocation à s'appliquer dès que possible dans les DOM. A noter qu'un programme d'acquisition de données complémentaires va encore couvrir les 2 années à venir, qui permettra notamment de régler certains problèmes particuliers d'évaluation rencontrés avec la première version d'IDR et de consolider la signature écologique affectée à quelques taxons indiciels. L'IDR a été pensé et élaboré pour pouvoir faire l'objet d'une utilisation en routine dans les réseaux institutionnels de surveillance et tout particulièrement dans le cadre du RCS, qui servira de réseau de base pour les opérations de rapportage de l'Etat Ecologique vers l'Union Européenne. Il convient de mentionner que les espèces de diatomées rencontrées à la Réunion étaient encore fortement méconnues jusqu'au déroulement du présent programme, certaines étant complètement endémiques de la Réunion ou des Mascareignes et d'autres, éventuellement connues dans d'autres zones tropicales ou tempérées de la planète, devant faire l'objet d'une recherche bibliographique à l'échelle mondiale pour établir les correspondances taxonomiques et morphologiques avec les espèces trouvées localement. Aussi, le présent guide taxonomique permet de résumer en langue française la connaissance taxonomique et écologique acquise à ce stade sur les diatomées des cours d'eau de la Réunion, afin de la rendre plus facilement accessible aux gestionnaires des hydrosystèmes et aux intervenants amenés à effectuer les identifications et comptages diatomiques dans le cadre des réseaux de surveillance. La première partie de ce guide permet proposer une classification iconologique de l'intégralité des 463 taxons trouvés à la Réunion au cours de ce programme de Recherche-Développement, au moyen de 21 planches agencées en fonction de critères d'organisation générale de la classification taxonomique des diatomées. Elle est suivie d'un recueil des fiches-taxons qui ont pu être élaborées après application d'un double seuillage des données quantitatives recueillies sur le taxon (faisant intervenir le nombre d'occurrences et les données d'abondance relative). En effet, pour les espèces qui ont été insuffisamment rencontrées au hasard des prélèvements de ce programme (trop faible occurrence et/ou très faibles effectifs), les données de présence sont trop lacunaires et trop aléatoires pour qu'il puisse être affecté une écologie fiable à ce taxon. Au stade actuel, il a été possible de formaliser 90 fiches-taxons. Ce recueil est bien sûr amené à évoluer à la hausse dans les prochaines années, en fonction de l'augmentation des référentiels capitalisés sur chaque taxon des cours d'eau Réunionnais.
(pp. 349 p., 12/04/2026)
UR REBX, CEMAGREF, EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS, LEFE, INEE-CNRS, CNRS, UT3, Comue de Toulouse, CNRS, Toulouse INP, Comue de Toulouse
Fate of arsenic-bearing phases during the suspended transport in a gold mining district (Isle river Basin, France)
Arsenic-rich (~ 140-1520 mg.kg− 1) suspended particulate matter (SPM) was collected daily with an automatic sampler in the Upper Isle River (France) draining a former gold mining district in order to better understand the fate of arsenic during the suspended transport (particles smaller than 50 μm). Various techniques at a micrometric scale (EPMA, quantitative SEM-EDS with an automated particle counting including classification system and μXRD) were used to directly characterize As-bearing phases. The most frequent ones were aggregates of fine clay particles. Their mineralogy varied with particle sources involved. These aggregates were formed by chlorite-phlogopite-kaolinite assemblages during the high flow and chlorite-illite-montmorillonite during the low flow. Among all the observed As-carriers in SPM, these clay assemblages were the least As-rich (0.10 up to 1.58 wt.% As) and their median As concentrations suggested that they were less concentrated during the high flow than during the low flow. Iron oxyhydroxides were evidenced by μXRD in these clay aggregates, either as micro- to nano-sized particles and/or as coating. (Mn, Fe)oxyhydroxides were also present as discrete particles. Manganese oxides (0.14-1.26 wt.% As) transport significantly more arsenic during the low flow than during the high flow (0.16-0.79 wt.% As). The occurrence of Fe oxyhydroxide particles appeared more complex. During the low flow, observations on banks and in wetlands of freshly precipitated Fe hydroxides (ferrihydrite-type) presented the highest As concentrations (up to 6.5 wt.% As) but they were barely detected in SPM at a microscale. During the high flow, As-rich Fe-oxyhydroxides (0.10-2.80 wt.% As) were more frequent, reflecting mechanical erosion and transport when the surface water level increased. Arsenic transfers from SPM to corresponding aqueous fraction mostly depend on As-carrier stability. This study shows the temporal occurrence of each type of As-bearing phases in SPM, their As concentrations at a particle scale and abundance according to hydrological periods.
(Science of the Total Environment. vol. 409, n° 0048-9697, pp. 4986-4999, 12/04/2026)
ISTO, INSU - CNRS, UO, UT, CNRS, GRESE, UNILIM, LSCE, UVSQ, INSU - CNRS, CNRS, DRF (CEA), CEA, ALS, LBNL, EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS
Biogeochemical modelling of anaerobic vs. aerobic methane oxidation in a meromictic crater lake (Lake Pavin, France)
Methane is a powerful greenhouse gas and its concentration in the atmosphere has increased over the past decades. Methane produced by methanogenic Archae can be consumed through aerobic and anaerobic oxidation pathways. In anoxic conditions found in freshwater environments such as meromictic lakes, CH4 oxidation pathways involving different terminal electron acceptors such as NO 3 , SO2 4 , and oxides of Fe and Mn are thermodynamically possible. In this study, a reactive transport model was developed to assess the relative significance of the different pathways of CH4 consumption in the water column of Lake Pavin. In most cases, the model reproduced experimental data collected from the field from June 2006 to June 2007. Although the model and the field measurements suggest that anaerobic CH4 oxidation may contribute to CH4 consumption in the water column of Lake Pavin, aerobic oxidation remains the major sink of CH4 in this lake.
(Applied Geochemistry. vol. 26, n° 0883-2927, pp. 1919-1932, 12/04/2026)
LGE, UPD7, IPG Paris, EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS, LMGE, UBP, UdA, CNRS, ISTO, INSU - CNRS, UO, UT, CNRS
Variability of fresh- and salt-water marshes characteristics on the west coast of France: A spatio-temporal assessment
The degradation of water quality and the multiple conflicts of interest between users make marsh restoration very important. A Water Quality Evaluation System (WQES) was developed for river systems by the European Water Framework Directive (WFD). Some form of biologically-based, habitat-specific reference standard seems absolutely essential for wise management and stewardship of marsh ecosystems. The goal of this study was to develop a statistical method to define and to characterize a water body typology for drained marshes of the Charente-Maritime wetlands on the French Atlantic coast, placing particular emphasis on environmental factors as hydraulic functioning, human activities and pedological substratum. The Charente-Maritime marshes represent a good field study because of his high diversity of types of marshes and of anthropogenic activities in a restrictive area thus erasing spatial climatic effect (latitude effect). The statistical method developed here had permitted to define and characterize 12 different water bodies, 7 in freshwater (F1 to F7) and 5 in salt water marshes for the Charente-Maritime area. This typology demonstrated an important link between the size catchment area, nitrate concentrations, and leaching of precipitation from cultured soils. Even though the Charente-Maritime marshes are strongly impacted by humans, they may still retain the ability to remove nitrate. The increasing gradient of water renewal in the freshwater marshes from F1 to F7 explained the decreasing gradient of eutrophication. A better management of the hydrodynamic of the marshes can avoid eutrophication risk on the coastal sea area. Reliance on the WFD parameter set necessarily placed limits on the kinds of interpretations that could be made and on the study's potential contribution to the basic science of marshes. Ecologically-based insights regarding both external flows (links between ecosystems, meta-ecosystem theory) and internal flows (structure of the planktonic food web) seem an essential prerequisite for further advances in the study of marsh ecosystems.
(Water Research. vol. 45, n° 0043-1354, pp. 4152 - 4168, 12/04/2026)
LIENSs, INSU - CNRS, ULR, CNRS, EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS, LCEE [Poitiers], UP, CNRS, UNIMA
Modeling biogeochemical processes in sediments from the Rhône River prodelta area (NW Mediterranean Sea)
In situ oxygen microprofiles, sediment organic carbon content, and pore-water concentrations of nitrate, ammonium, iron, manganese, and sulfides obtained in sediments from the Rhône River prodelta and its adjacent continental shelf were used to constrain a numerical diagenetic model. Results showed that (1) the organic matter from the Rhône River is composed of a fraction of fresh material associated to high first-order degradation rate constants (11-33 yr−1); (2) the burial efficiency (burial/input ratio) in the Rhône prodelta (within 3 km of the river outlet) can be up to 80 %, and decreases to ~20 % on the adjacent continental shelf 10-15 km further offshore; (3) there is a large contribution of anoxic processes to total mineralization in sediments near the river mouth, certainly due to large inputs of fresh organic material combined with high sedimentation rates; (4) diagenetic by-products originally produced during anoxic organic matter mineralization are almost entirely precipitated (>97 %) and buried in the sediment, which leads to (5) a low contribution of the re-oxidation of reduced products to total oxygen consumption. Consequently, total carbon mineralization rates as based on oxygen consumption rates and using Redfield stoichiometry can be largely underestimated in such River-dominated Ocean Margins (RiOMar) environments.
(Biogeosciences. vol. 8, n° 1726-4170, pp. 1351-1366, 12/04/2026)
IPGP, INSU - CNRS, UPD7, UR, IPG Paris, CNRS, LSCE, UVSQ, INSU - CNRS, CNRS, DRF (CEA), CEA, EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS, NIOO-KNAW, LAERO, IRD, UT3, Comue de Toulouse, INSU - CNRS, CNRS, BIAF, UA, OCEANIS, LSCE, UVSQ, INSU - CNRS, CNRS, DRF (CEA), CEA
Potentiel of TerraSAR-X imagery for mapping intertidal coastal wetlands
This work presents preliminary results about the use of TerraSAR-X imagery for mapping intertidal habitats (oyster parks, seagrass meadows of Zostera noltii, sediments) along coastal lagoons (Arcachon lagoon, France). The combination of SAR and optical data appears to be useful to improve the discrimination of the various sediment and vegetation covers into classification schemes. Unlike optical imagery which may lead to misinterpret sediment type, the potential of the multi-polarization SAR data is assessed notably regarding its efficiency for separating intertidal (Z. noltii) from supratidal salt-marsh vegetation species (spartina, salicornia, and so on). TerraSAR-X imagery is also an excellent highlighter of areas colonized by oysters (both cultivated and invasive ones) due to their relevant roughness signature among neighbored facies. In contrast, mapping methods based on optical data alone often do not perform well because of the presence of algae on oyster shelves. Moreover, potential exists for discrimating unvegetated soils but biofilm-covered from low-vegetated ones. As a conclusion, TerraSAR-X imagery offers many tracks to increase the performance of thematic mapping products along intertidal environments, in complement of optical data.
(pp. 9, 12/04/2026)
EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS, UMR TETIS, Cirad, CEMAGREF, IRSTEA
Evolution taxonomique de biofilms diatomiques en condition de décontamination métallique expérimentale après colonisation sur site contaminé
Le système fluvio-estuarien de la Gironde (France) est soumis depuis plus d'un siècle à une contamination polymétallique (Cd et Zn) s'étendant du Lot jusqu'à l'estuaire de la Gironde. Des études géochimiques ont montré que les apports en Cd et Zn proviennent essentiellement d'un site industriel spécialisé dans le traitement du minerai de zinc, localisé environ 400 km en amont de l'estuaire. Depuis 2007, un important plan de remédiation du site industriel a été mis en place. Ces travaux devraient durer jusqu'en 2012. Dans ce contexte de gestion corrective, et en référence à l'état initial de contamination déterminé par des études antérieures (programme national Ecodyn), cette étude s'intègre dans le cadre d'un projet ANR pluridisciplinaire (RESYST) et a pour objectif d'étudier l'impact de la mise en place de la remédiation sur les biofilms diatomiques. Afin de caractériser les cinétiques de récupération des diatomées, une étude expérimentale de décontamination du biofilm a été menée en laboratoire. La colonisation des biofilms s'est déroulée durant 24 jours sur un site subissant les rejets métalliques industriels et parallèlement sur un site en amont sans métaux, considéré comme témoin. Les biofilms ont ensuite été ramenés et maintenus en laboratoire durant 56 jours en condition de décontamination, ou de contamination artificielle à partir de solutions de Cd et de Zn. Différentes analyses ont été réalisées du niveau communautaire - mesures de la bioaccumulation métallique, des densités cellulaires et investigations taxonomiques - jusqu'au niveau individuel : déformation des frustules. Après 56 jours de décontamination, les concentrations en Cd dans les biofilms montrent une forte décroissance mais restent significativement supérieures aux concentrations mesurées dans les biofilms témoins. Par ailleurs, les inventaires taxonomiques ne permettent pas de mettre en évidence une restauration des communautés diatomiques dans les biofilms en décontamination comparativement à la condition témoin. En effet, après 56 jours de décontamination, malgré l'apparition d'espèces opportunistes sensibles aux métaux, pouvant être liées aux conditions expérimentales, les espèces résistantes aux métaux présentes initialement après colonisation sur site contaminé, persistent en abondances élevées dans les biofilms en décontamination. A la lumière de ces premiers résultats sur le comportement des biofilms diatomiques en conditions expérimentales de décontamination, l'amélioration de l'état chimique de l'hydrosystème naturel apparaît rapidement mais un éventuel retour au bon état écologique préconisé dans la DCE semble différé avec la persistance d'espèces tolérantes aux métaux. Ces résultats seront confrontés aux investigations menées en parallèle in situ afin de révéler ou non les prémices d'un retour au bon état écologique.
(pp. 1, 12/04/2026)
EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS, UR REBX, CEMAGREF
Suivi de la contamination des tributaires du Bassin d'Arcachon par les pesticides et tests écotoxicologiques sur diatomées
L'échantillonnage passif des substances organiques de synthèse suscite un intérêt croissant depuis son apparition par son gain de représentativité temporelle, sa facilité de mise en ½uvre et son coût acceptable. Depuis le début des années 1990, plusieurs dispositifs ont été développés pour échantillonner différents types de contaminants. Le Polar Organic Chemical Integrative Sampler (POCIS) est l'outil le plus adapté à l'échantillonnage des pesticides pour différentes applications (e.g. monitoring ; appui à l'écotoxicologie), en particulier grâce à l'utilisation d'un composé de performance et de référence (PRC). L'objectif de cette étude est de caractériser la pollution à pesticides dans neuf des principaux tributaires du Bassin d'Arcachon. Des POCIS ont été déployés pour l'échantillonnage des pesticides neutres (i.e. 1
(pp. 1, 12/04/2026)
UR REBX, CEMAGREF, EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS