Cartographie des habitats naturels des estrans et zones humides littorales
A l’interface entre terre et mer, les zones humides littorales sont des environnements dont le fonctionnement écosystémique est contraint par les forçages climatiques et anthropiques. Par le biais des directives européennes et des plans de gestion, ces milieux sont suivis et cartographiés à échéance régulière dans le but d’asseoir leur état écologique. Différentes stratégies de cartographie basées sur l’exploitation d’images satellite sont adoptées selon les objectifs à atteindre : (1) cartographie exhaustive des faciès/habitats intertidaux (type Natura 2000), (2) cartographie de l’herbier à Zostera noltii (Directive Cadre sur l’Eau), (3) cartographie des habitats des prés-salés, (4) suivi de l’évolution naturelle des paysages et de la végétation en lien avec des événements accidentels ou volontaires (actions de dépoldérisation). Cet article dresse un panorama des stratégies de cartographie exploitant des données optiques et radar à Haute (SPOT-5) et Très Haute Résolution Spatiale (Pléiades, TerraSAR-X) mises au point pour répondre aux besoins d’observation et d’expertise pour la gestion intégrée des milieux littoraux lagunaires.
(Revue Française de Photogrammétrie et de Télédétection. vol. 208, n° 1768-9791, pp. 51-56, 30/08/2026)
EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS, UMR TETIS, Cirad, IRSTEA, CESBIO, IRD, UT3, Comue de Toulouse, INSU - CNRS, CNES, CNRS, INRAE, UB, ULR
Developmental toxicity of PAH mixtures in fish early life stages. Part I: adverse effects in rainbow trout
A new gravel-contact assay using rainbow trout, Oncorhynchus mykiss, embryos was developed to assess the toxicity of polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) and other hydrophobic compounds. Environmentally realistic exposure conditions were mimicked with a direct exposure of eyed rainbow trout embryos incubated onto chemical-spiked gravels until hatching at 10 °C. Several endpoints were recorded including survival, hatching delay, hatching success, biometry, developmental abnormalities, and DNA damage (comet and micronucleus assays). This bioassay was firstly tested with two model PAHs, fluoranthene and benzo[a]pyrene. Then, the method was applied to compare the toxicity of three PAH complex mixtures characterized by different PAH compositions: a pyrolytic extract from a PAH-contaminated sediment (Seine estuary, France) and two petrogenic extracts from Arabian Light and Erika oils, at two environmental concentrations, 3 and 10 μg g−1 sum of PAHs. The degree and spectrum of toxicity were different according to the extract considered. Acute effects including embryo mortality and decreased hatching success were observed only for Erika oil extract. Arabian Light and pyrolytic extracts induced mainly sublethal effects including reduced larvae size and hemorrhages. Arabian Light and Erika extracts both induced repairable DNA damage as revealed by the comet assay versus the micronucleus assay. The concentration and proportion of methylphenanthrenes and methylanthracenes appeared to drive the toxicity of the three PAH fractions tested, featuring a toxic gradient as follows: pyrolytic < Arabian Light < Erika. The minimal concentration causing developmental defects was as low as 0.7 μg g−1 sum of PAHs, indicating the high sensitivity of the assay and validating its use for toxicity assessment of particle-bound pollutants.
(Environmental Science and Pollution Research. vol. 21, n° 0944-1344, pp. 13720-13731, 30/08/2026)
UB, EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS, LPGP, INRA, Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique, BE, IFREMER
Impact of dietary cadmium sulphide nanoparticles on Danio rerio zebrafish at very low contamination pressure.
: Abstract To address the impact of cadmium sulphide nanoparticles (CdSNPs) of two different sizes (8 and 50 nm), Danio rerio zebrafish were dietary exposed to very low doses: 100 or 40 ng CdSNPs/day/g body weight for 36 or 60 days, respectively. The results obtained using RAPD-PCR genotoxicity test showed genomic alteration since the number of hybridisation sites of the RAPD probes was significantly modified after CdSNPs exposure. In addition, selected stress response genes were either repressed or upregulated in tissues of CdSNPs-exposed fish. Mitochondrial dysfunction was also caused by the presence of CdSNPs in food. Cadmium accumulation in fish tissues (brain and muscles) could only be observed after 60 days of exposure. CdSNPs toxicity was dependent on their size and concentration.
(Nanotoxicology. vol. 8, n° 1743-5390, pp. 676-685, 30/08/2026)
EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS, ICMCB, UB, INC-CNRS, CNRS, IBGC, UB, CNRS
A community-based geological reconstruction of Antarctic Ice Sheet deglaciation since the Last Glacial Maximum
(Quaternary Science Reviews. vol. 100, n° 0277-3791, pp. 1 - 9, 30/08/2026)
GCU, BAS, NERC, UGent, LGP, UP1, UPEC UP12, CNRS, EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS, IWF, OeAW, USF, CAM, DGES, LOCEAN, IPSL, ENS-PSL, PSL, UVSQ, UPMC, CEA, INSU - CNRS, X, IP Paris, CNES, CNRS, MNHN, IRD, UPMC, INSU - CNRS, CNRS, ULaval, INSU - CNRS, CNRS, PSI, NIFS, LDEO
Etude intégrée de l’effet des apports amont et locaux sur le fonctionnement de la Garonne estuarienne (ETIAGE) : Rapport de synthèse année 4 Avril 2013 - Mars 2014
Le programme ETIAGE a été mis en place avec pour objectif de répondre aux questions suivantes : que représentent les apports des effluents de la Communauté Urbaine de Bordeaux (CUB) par rapport à ceux venant de l’amont en termes de charge organique et de micro-polluants ? Quels rôles sur le devenir des effluents jouent la présence du bouchon vaseux et la stagnation résiduelle des eaux (déplacement net entre mouvement de flot et de jusant) au niveau de l’estuaire fluvial amont en période d’étiage estival ? Réciproquement, à quels moments et jusqu’où s’étend l’impact de ces effluents sur la qualité des eaux de la Garonne estuarienne ? Quelles incidences des effluents sur le comportement des populations biologiques en place ou migratoires dans la Garonne estuarienne ? Quelle tendance évolutive va connaître l’oxygénation des eaux ? Quel sera l’impact sur le comportement des micro-polluants et des populations biologiques ? Quelles recommandations de gestion pourraient être préconisées à partir de la synthèse des pressions exercées sur les eaux de la Garonne estuarienne ? Le programme est divisé en 5 axes, dont les bilans de travail sont présentés axe par axe.
(pp. 76, 30/08/2026)
UR EABX, IRSTEA, EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS
Impact of precession on the climate, vegetation and fire activity in southern Africa during MIS4
The relationships between climate, vegetation and fires are a major subject of investigation in the context of climate change. In southern Africa, fire is known to play a crucial role in the existence of grasslands and Mediterranean-type biomes. Microcharcoal-based reconstructions of past fire activity in that region have shown a tight correlation between grass-fueled fires and the precessional cycle, with maximum fire activity during maxima of the climatic preces-sion index. These changes have been interpreted as the result of changes in fuel load in response to precipitation changes in eastern southern Africa. Here we use the general circulation model IPSL_CM5A (Institut Pierre Simon Laplace Climate Model version 5A) and the dynamic vegetation model LPJ-LMfire to investigate the response of climate, vegetation and fire activity to precession changes in southern Africa during marine isotopic stage 4 (74–59 kyr BP). We perform two climatic simulations, for a maximum and minimum of the pre-cession index, and use a statistical downscaling method to increase the spatial resolution of the IPSL_CM5A outputs over southern Africa and perform high-resolution simulations of the vegetation and fire activity. Our results show an anticorre-lation between the northern and southern African monsoons in response to precession changes. A decrease of the preces-sion climatic index leads to a precipitation decrease in the summer rainfall area of southern Africa. The drying of climate leads to a decrease of vegetation cover and fire activity. Our results are in qualitative agreement with data and confirm that fire activity in southern Africa during MIS4 is mainly driven by vegetation cover.
(Climate of the Past. vol. 10, n° 1814-9324, pp. 1165-1182, 30/08/2026)
PACEA, UB, CNRS, EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS, IPSL, ENS-PSL, PSL, UVSQ, UPMC, CEA, INSU - CNRS, X, IP Paris, CNES, CNRS, LSCE, UVSQ, INSU - CNRS, CNRS, DRF (CEA), CEA, CLIM, LSCE, UVSQ, INSU - CNRS, CNRS, DRF (CEA), CEA
Phytobenthos des cours d’eau de la Réunion : l’Indice Diatomées Réunion (IDR)
La Directive 2000/60/CE (DCE), qui vise à l'atteinte ou au maintien du Bon Etat Ecologique des masses d'eau européennes au terme de 2015, s'applique de droit pour les Départements d'Outre-Mer comme pour le territoire métropolitain. Les indices biologiques développés en métropole (exemples : IPS, IBD 2007 sur les diatomées benthiques des cours d'eau) ont été testés et posent d’importants problèmes d'assise taxonomique les rendant inappropriés dans un contexte biogéographique éloigné et isolé. C'est typiquement le cas pour la Réunion, dont les cortèges biologiques (faune, flore) se sont structurés sur un volcan ayant émergé directement depuis le fond de l'Océan Indien, conduisant à des milieux naturels d’eaux douce très isolés par le domaine maritime. De fait, les assemblages diatomiques locaux sont bien spécifiques et beaucoup d’espèces trouvées sur place sont présumées endémiques du fait de cet isolement, de conditions naturelles locales très particulières et de différences morphologiques plus ou moins marquées par rapport aux flores connues ailleurs dans le mondet. A la demande de l'Office de l'Eau de la Réunion, un programme de recherche spécifique impliquant le consortium ASCONIT-IRSTEA a été initialement mis en place entre 2008 et 2011. Il a ensuite connu des actualisations jusqu’à fin 2012, au gré de l’acquisition et de l’incorporation de nouvelles données. Les objectifs généraux du programme étaient : 1) l'acquisition de la connaissance taxonomique et hydro-écologique concernant les assemblages diatomiques locaux, 2) l'élaboration d'un guide taxinomique récapitulant les informations sur les espèces qui présentent un intérêt en monitoring, et 3) la genèse d'un nouvel indice diatomique (I.D.R.) bâti sur les référentiels acquis au cours de l'étude et permettant une évaluation judicieuse et robuste de l'Etat Ecologique des cours d'eau de la Réunion. Entre la fin du programme initial et fin 2012, les relevés utilisables sont passés de 269 à 345. Au final, après double seuillage portant sur l’occurrence du taxon et son abondance relative minimale dans au moins un relevé, 182 taxons ont pu se voir calculer un profil de qualité dans le Gradient Composite Multimétrique d’Anthropisation (GCMA). 12 taxons ayant une écologie typiquement halophile selon la littérature (influences halines littorales s’exerçant sur l’aval de certains cours d’eau), ce sont donc 170 taxons qui se sont vus attribuer un profil écologique dans l’IDR et qui participent effectivement à son calcul. Parmi eux, 125 taxons, qualifiés de Taxons +, ne revêtent aucune signification particulière sur le plan de l’altération anthropique. 55 espèces ont été qualifiées de taxons d’alerte à la signification gradée, parmi lesquelles 17 Taxons 3- (couleur rouge), 21 Taxons 2- (couleur orange) et 17 taxons- (couleur jaune), affectés d’un poids différent dans le calcul d’indice. Des exemples emblématiques de ces catégories de taxons seront présentés. La nouvelle version d’IDR, l’IDR V5-3, a résolu les problèmes de jeunesse de la première version. Elle a servi à repérer les niveaux de notes de référence pour 2 grands ensembles naturels de la Réunion (Côte Ouest sèche et chaude versus Côte Est plus fraîche et pluvieuse) et à établir 2 grilles d’évaluation exprimées en EQRs. Ces grilles sont d’ores et déjà utilisables pour évaluer l’état écologique de sites à chaque date sur la base de relevés individuels. Elles ont été utilisées, avec un principe d’One Out-All Out ménagé, pour réaliser une intégration temporelle de l’état écologique au site. Cependant, un principe différent d’agrégation va être adopté dans un prochain Arrêté d’évaluation à paraître prochainement, qui utilisera la moyenne des notes indicielles sur 3 ans, ce qui provoque une compression assez conséquente de l’échelle d’évaluation. Les grilles d’évaluation proposées pour l’Arrêté vont donc devoir être réadaptées et recalées pour pouvoir satisfaire à ce grain d’évaluation intégrée, qui n’avait pas fait l’objet de scénario d’étude.
(pp. 15, 30/08/2026)
UR EABX, IRSTEA, EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS
The Grand Popo experiment, Benin
The first large nearshore field experiment in the G ulf of Guinea was conducted at Grand Popo Beach, Be nin, in February 2013, on an open wave-dominated micro- to meso-tidal coast, located mid-way between Cotonou and Lome harbours. The overall project aims at understanding at multi-scale (from event to interannual) the causes of the dramatic erosion observed throughout the Bight of Benin, and caused by the interaction of a large littoral drift with human engineering works. Grand Popo 2013 experiment was designed to measure the processes over the short term and to test the ability of an installed video system to monitor the evolution of this stretch of coast over the longer term. The beach, characterized by a low-tide terrace and a high tide reflective part, experiences a long swell (Hs=1.6m, Tp=16 s, oblique incidence ~15-20°). Topographic surveys showed a double beach cusp system interaction and repeated surf-zone drifter runs revealed high flash and swash rip activity driven by wave dissipation over the terrace and energetic swash dynamics at the upper reflective beach. Swash was measured over a cusp system at two locations using video poles. Wave reanalyses (ERAInterim) were used to determine the wave climate and its variability, and to quantify sediment transport. This robust methodology is thought to be replicated elsewhere in different coastal environments in West Africa, in particular with the objective to monitor various sites within the framework of the new West African Coastal Observatory.
(Journal of Coastal Research. vol. SI 70, n° 0749-0208, pp. pp. 651-656, 30/08/2026)
ECOLA, LEGOS, IRD, UT3, Comue de Toulouse, INSU - CNRS, CNES, CNRS, UAC, EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS, CEREGE, IRD, INRA, AMU, CdF (institution), INSU - CNRS, CNRS, IRD [France-Ouest], OLVAC, LEGOS, IRD, UT3, Comue de Toulouse, INSU - CNRS, CNES, CNRS
Abnormal ovarian DNA methylation programming during gonad maturation in wild contaminated fish
There is increasing evidence that pollutants may cause diseases via epigenetic modifications. Epigenetic mechanisms such as DNA methylation participate in the regulation of gene transcription. Surprisingly, epigenetics research is still limited in ecotoxicology. In this study, we investigated whether chronic exposure to contaminants experienced by wild female fish (Anguilla anguilla) throughout their juvenile phase can affect the DNA methylation status of their oocytes during gonad maturation. Thus, fish were sampled in two locations presenting a low or a high contamination level. Then, fish were transferred to the laboratory and artificially matured. Before hormonal treatment, the DNA methylation levels of the genes encoding for the aromatase and the receptor of the follicle stimulating hormone were higher in contaminated fish than in fish from the clean site. For the hormone receptor, this hypermethylation was positively correlated with the contamination level of fish and was associated with a decrease in its transcription level. In addition, whereas gonad growth was associated with an increase in DNA methylation in fish from the clean site, no changes were observed in contaminated fish in response to hormonal treatment. Finally, a higher gonad growth was observed in fish from the reference site in comparison to contaminated fish.
(Environmental Science and Technology. vol. 48, n° 0013-936X, pp. 11688--11695, 30/08/2026)
µVIS X-ray Imaging Centre, LPTC, UB, CNRS, EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS, UR EABX, IRSTEA, ISM, UB, INC-CNRS, CNRS, BOREA, UNICAEN, NU, MNHN, IRD, SU, CNRS, UA, INRS
Preface "The changing Arctic and Subarctic environment: proxy- and model-based reconstructions of Holocene climate variability in the northern North Atlantic
This special issue originates from the EU FP7-Marie Curie initiative "CASE" (The Changing Arctic and Subarctic Environment), an Initial Training Network (ITN) on marine biotic indicators of recent climate changes in the high latitudes of the North Atlantic (http://caseitn.epoc.u-bordeaux1.fr/). This four-year project (April 2010-March 2014) implemented multidisciplinary research initiatives aiming at assembling palaeoclimate data from the Holocene through recent field programmes in the Nordic Seas, and at integrating palaeoclimate information with modern biological and climate modelling data. Associated objectives were to recruit and train a new generation of European polar scientists with expertise on the Nordic Seas, and to develop a network of European experts in polar research to build structures focused on long-term collaboration in Arctic science. Together with the Arctic Ocean, the Nordic Seas and the Barents Sea have shown unprecedented changes in physical and chemical conditions in recent decades, which directly influence the ecosystem structure and processes. The extreme sensitivity of the northern North Atlantic to climate changes is related to the intricate connection, within this oceanic realm, of cryospheric (ice sheets and sea ice), atmospheric (winds related to strong gradients in sea-level pressures), and oceanic processes (through the opposing poleward flow of Atlantic water and southward flow of polar waters). The recent decline in seasonal sea ice extent is of particular concern as it modulates the reflection of incoming solar radiation, and influences the exchanges of heat and moisture between the surface ocean and the atmosphere. Moreover, sea ice also plays a central role in the efficiency of shelf (brines) and deep ocean convection processes, thus influencing the climate on a global scale. Decadal to millennial scale reconstructions of Holocene climate and environments from archives, such as marine sediment cores, and from palaeoclimate modelling hold keys to a better evaluation of the magnitude and implications of the ongoing warming with regard to the full range natural variability of the climate system. This special issue addresses some of the key questions raised by the CASE project and related to the present polar amplification of climate change: -Is the present global warming and its amplification in the Arctic and Subarctic domains a unique event on the scale of the Earth recent history (last 10 000 years)? -How do past decadal-to centennial-scale natural climate changes, as recorded in marine sediments and ice cores, stand in the context of the present human-induced modulation of climate? -How did Holocene variability in key physical elements affect the structure and diversity of the planktonic ecosystem in the Arctic and Subarctic domains?
(Climate of the Past. vol. 10, n° 1814-9324, pp. 589-590, 30/08/2026)
EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS, UvA, LMD, INSU - CNRS, X, IP Paris, ENPC, SU, CNRS, ENS-PSL, PSL