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Modulation de la toxicité des métaux vis-à-vis du développement des biofilms de cours d'eau (bassin versant de Decazeville, France)

Soizic Morin, T.T. Duong, Sébastien Boutry, Michel Coste

Des études de terrain sur des biofilms matures nous ont permis de souligner une modulation de la toxicité des métaux lourds (cadmium, zinc) en fonction de la disponibilité nutritive. Ainsi, le long d'un gradient de contamination organique et métallique (bassin versant de Decazeville, France), le biofilm se développe plus abondamment (en épaisseur, en densité) dans des conditions nutritives élevées, et de façon comparable en conditions de contamination organique importante et de contaminations combinées nutriments / métaux. L'épaisseur du biofilm exerce un effet protecteur des métaux par : (i) l'existence de gradients de diffusion limitant leur pénétration vers les couches internes du biofilm, (ii) une mortalité élevée des cellules superficielles de la matrice, agissant comme une barrière supplémentaire, (iii) la production par les organismes de polypeptides complexant le métal sous forme moins biodisponible.

(Cryptogamie Algologie. vol. 29, n° 0181-1568, pp. 201-216, 23/02/2026)

UR REBX, CEMAGREF, EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS

Seasonal record of foraminiferal export fluxes in the Bay of Biscay

Neven Lončarić, Hélène Howa, Sabine Schmidt

(23/02/2026)

LPGN, UN, CNRS, EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS

SPM fluxes estimates from discrete monitoring : comparison of calculation methods and uncertainties

Florentina Moatar, Michel Meybeck, Sebastien Raymond, Alexandra Coynel, Wolfgang Ludwig, Vincent Mano, Julien Nemery, Alain Poirel, Henri Etcheber, Philippe Crouzet

The SPM (suspended particulate matter) fluxes temporal variabilities are even more complex than water flows and are therefore very difficult to estimate. In France, SPM are surveyed within the national water quality survey system (RNB) and are monitored with a bimonthly or monthly frequency, as other water quality indicators. The flux calculation methods and their related uncertainties on the basis of an experimental data set of continuous – i.e. daily monitoring for contrasted river basins ranging from 100 to 100 000 km2 (in France and in USA, 60 stations totalling 600 station-year of daily SPM and flows). The uncertainties, biases, and errors, result from the analysis of the distribution of errors made on simulated surveys at various frequencies (3, 5, ... 30 days) in comparison to the same value. The duration curves of SPM fluxes and the key indicator M2 %, i.e. the percentage of SPM carried in 2 % of time on a multiannual period (4 to 20 y), are then determined. The M2 % indicator is used to build-up a nomograph linking biases (median or errors) and imprecision (difference between upper and lower deciles of errors) to monitoring frequencies (3, 4, ... 30 days). This nomograph can be used to : i) optimize surveys frequencies, given a flux error target, or to ii) associate error bars. The nomograph is so far established for the mean discharge-weighted concentration method, one of the most common method with the rating curve method.

(La Houille Blanche - Revue internationale de l'eau. vol. 4, n° 0018-6368, pp. 64 à 71, 23/02/2026)

SISYPHE, UPMC, EPHE, PSL, PSL, CNRS, EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS, CEFREM, UPVD, INSU - CNRS, CNRS, LTHE, OSUG, UJF, Grenoble INP, INSU - CNRS, IRSTEA, USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry], CNRS, IRD, INSU - CNRS, INPG, CNRS, EDF [E.D.F.], AEE

Assessment of the ecological quality status of soft-bottoms in Reunion Island (tropical Southwest Indian ocean) using AZTI marine biotic indices

Lionel Bigot, Antoine Grémare, Jean-Michel Amouroux, Frouin Patrick, Olivier Maire, Jean Claude Gaertner

(Marine Pollution Bulletin. vol. 56, n° 0025-326X, pp. 704-722, 20/12/2007)

ECOMAR, UR, EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS, LOBB, OOB, UPMC, CNRS, UPMC, INSU - CNRS, CNRS, LMGEM, CNRS

Net and gross incorporation of nitrogen by marine copepods fed on 15N labelled diatoms: methodology and trophic studies

Dorothée Vincent, G. Slawyk, Stéphane L'Helguen, Géraldine Sarthou, Morgane Gallinari, Seuront Laurent, B. Sautour, Olivier Ragueneau

The stable isotope of nitrogen (15N) and an appropriate three-compartment model were used in two 24-h lasting feeding experiments to trace the flow of N through the copepod Acartia discaudata and Calanus helgolandicus fed on 15N-labelled Skeletonema costatum and Thalassiosira weissflogii, respectively. Details of the labelling technique and principles of the computation of N transport rates are given. At the end of a single 24-h feeding period only about one third of the total amount of N ingested by A. discaudata was incorporated into the copepod's body N; we refer to this rate as net incorporation. Most of the N ingested was lost as ammonium (48% of total N ingested), followed by losses in the form of eggs + fecal pellets (13%) and dissolved organic N (DON, 9%). The sum of net incorporation and the latter losses is defined as gross incorporation. Net incorporation by C. helgolandicus and N losses did not vary over time during a 24 h lasting time-series feeding experiment. On average, 79% of total N ingested was actually incorporated by the copepod whereas mean N losses as ammonium, eggs + fecal pellets represented only 12 and 9%, respectively. After a 24-h feeding period only 2% of N ingested was lost as DON. Inspection of individual DON pathways showed that both A. discaudata and C. helgolandicus highly contributed to total DON production via direct excretion (79 and 64%, respectively). The remaining DON appearing in the DON pool was derived from phytoplankton via direct release and/or indirect release (copepod ‘sloppy feeding’).

(Journal of Experimental Marine Biology and Ecology. vol. 352, n° 0022-0981, pp. 295-305, 14/12/2007)

ELICO, ULCO, CNRS, ULCO, AD2M, SBR, UPMC, CNRS, UPMC, CNRS, LEMAR, IRD, IFREMER, UBO EPE, CNRS, EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS

PROCESSUS BIOGEOCHIMIQUES DES ZONES INTERTIDALES DES SYSTEMES LAGUNAIRES : LE BASSIN D'ARCACHON (SW, FRANCE)

Jonathan Deborde

Les environnements lagunaires, interfaces entre le continent et l'océan, sont sujets à d'importants apports continentaux qui supportent une forte production biologique. Cette richesse écologique unique en fait des écosystèmes parmi les plus productifs de la planète à l'origine d'une activité économique importante. La gestion et la préservation de ces milieux sont difficiles car l'étude des cycles biogéochimiques est encore incomplète. Dans le cadre de cette thèse, qui s'inscrit dans le Programme National d'Environnement Côtier " Chantier Littoral Atlantique " et l'ANR PROTIDAL, un effort particulier est mis sur le rôle des zones intertidales dans le bilan du métabolisme net du système lagunaire du Bassin d'Arcachon, les processus biogéochimiques aux différentes interfaces et leurs interactions avec les cycles tidaux, les mécanismes pélagiques et le degré de colonisation biologique du substrat à différentes échelles de temps (marée, saison). Il a été démontré que les eaux des chenaux tidaux drainant les platiers intertidaux à marée descendante étaient le résultat de la percolation, diffusion et advection d'eaux interstitielles anoxiques depuis les sédiments vaseux et sableux. Ces eaux sont enrichies en produits de dégradation de la matière organique, tels que l'ammonium, les phosphates, le SCO2, le CH4 et les métaux dissous. Un premier essai de bilan à l'échelle de la lagune démontre l'importance de ce processus de pompage tidal dans le budget global en sels nutritifs de la lagune. La colonisation du substrat par les herbiers de macrophytes apparaît comme un facteur déterminant sur les associations biologiques et les distributions géochimiques des espèces biogènes. Une stratification de l'eau interstitielle est observée sur certains profils reflétant leur production, leur consommation par les processus de minéralisation de la matière organique, leur prélèvement par le système racinaire des macrophytes, et des mécanismes de transports biologiques ou physiques. A la différence des sédiments subtidaux et stationnaires, dans lesquels la diffusion moléculaire est le premier mécanisme de transport des solutés, la distribution verticale géochimique dans les sédiments intertidaux est dominée par la bioirrigation et les interactions avec les macrophytes, conférant une très forte hétérogénéité spatiale et saisonnière. Une interaction très forte entre les cycles du fer et du phosphore avec la dynamique annuelle de ces herbiers a été découverte, précisant que le rapport entre la surface couverte par les herbiers et celle non-végétalisée est un paramètre majeur du bilan de masse en phosphore dans le Bassin d'Arcachon. Ce travail propose également la première estimation d'un bilan des sources, puits et flux de méthane aux différentes interfaces dans le Bassin d'Arcachon et dans un environnement lagunaire tempéré. Les rivières et les sédiments lagunaires représentent les deux sources pour la colonne d'eau. L'essentiel du méthane produit est oxydé dans les sédiments par les sulfates entrainant de faibles flux benthiques. Les flux atmosphériques depuis les eaux et les sédiments du Bassin d'Arcachon sont faibles en comparaison à ceux estimés dans d'autres systèmes côtiers. Ce bilan montre que la totalité du CH4 apporté par les rivières et diffusé depuis les sédiments vers la colonne d'eau de la lagune, est transférée vers l'atmosphère au cours de la résidence des eaux dans la lagune, et que cet écosystème est une source nulle de méthane pour l'océan côtier ouvert.

(06/12/2007)

EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS

Role of metallothioneins in superoxide radical generation during copper redox cycling: Defining the fundamental function of metallothioneins

Maud Achard-Joris, Jean-Luc Moreau, Megumi Lucas, Magalie Baudrimont, Nathalie Mesmer-Dudons, Patrice Gonzalez, Alain Boudou, Jean-Paul Bourdineaud

In order to demonstrate the in vivo antioxidant properties of metallothioneins (MTs), the bacteria Escherichia coli was used as a cell reactor in which we compared the metal binding and antioxidative functions of MTs from different species, with different structures and polypeptide lengths. No protective effects of cytoplasmic MTs from cadmium (Cd) or zinc (Zn) contamination were observed in a wild-type E. coli strain, although these MTs can efficiently bind both Cd and Zn. To test their antioxidant properties, MTs were expressed within the cytoplasm of a sodA sodB deficient mutated strain (QC1726). However, a paradoxical MT toxicity was found when this strain was contaminated with Cd and Zn, suggesting that in a wild-type strain, superoxide dismutase counteracts MT toxicity. The most toxic MT was the one with the strongest Cd and Zn binding capacities. This toxic effect was linked to the generation of superoxide radicals, since a Cd-contaminated QC1726 strain expressing oyster MT isoforms produced 75-85% more O(2)*(-) than the control QC1726 strain. Conversely, under anaerobiosis or in the presence of a copper chelator, MTs protected QC1726 strain from Cd and Zn contamination. A model is proposed to explain the observed MT toxicity.

(Biochimie. vol. 89, n° 0300-9084, pp. 1474-1488, 01/12/2007)

EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS

Les foraminifères benthiques : bio-indicateurs l'eutrophisation naturelle et anthropique en milieu marin franc

Meryem Mojtahid

Ce travail de thèse a pour objectif d'évaluer la possibilité d'utilisation des foraminifères benthiques comme bio-indicateurs des phénomènes d'eutrophisation en milieu marin ouvert. Le but de notre étude est de comparer différents types d'environnements eutrophiés, sous des conditions naturelles (sédiments du prodelta du Rhône) et anthropiques (déblais de forages pétroliers au large du Congo et du Gabon ; boues d'épuration dans le Firth of Clyde en Écosse). Dans ce contexte, nous avons étudié la distribution spatiale des foraminifères benthiques et l'avons comparée aux paramètres physico-chimiques mesurés. Ces micro-organismes font partie des protistes les plus abondants dans les environnements marins benthiques. En raison de leur forte biodiversité, des courts cycles de vie et des exigences écologiques très variables des différentes espèces, les faunes de foraminifères réagissent rapidement aux perturbations environnementales. Notre étude révèle l'existence d'une succession faunistique typique en réponse à un gradient croissant d'enrichissement organique. Ainsi, en s'approchant de la zone la plus eutrophiée, une diminution des espèces caractéristiques des environnements stables est observée ; ces espèces sont remplacées progressivement par des espèces opportunistes en milieu fortement enrichi. Si la perturbation environnementale est persistante, seules des espèces très résistantes au stress environnementale sont présentes, généralement avec des faibles densités. Les foraminifères benthiques représentent donc un très bon outil d'évaluation de l'état de santé d'un environnement. Ces bio-marqueurs peuvent être employés avec succès dans des suivis d'impact environnemental et dans des réseaux de surveillance des milieux marins afin d'aider à évaluer les perturbations des écosystèmes.

(23/11/2007)

EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS

High resolution seafloor images in the Gulf of Cadiz, Iberian margin

Vincent Hanquiez, Thierry Mulder, Pascal Lecroart, Eliane Gonthier, Elodie Marches, Michel Voisset

In the Gulf of Cadiz, the hydrodynamic process acting on particle transport and deposition is a strong density-driven bottom current caused by the outflow of the saline deep Mediterranean water at the Strait of Gibraltar: the Mediterranean Outflow Water (MOW). New high resolution acoustic data including EM300 multibeam echo-sounder, deep-towed acoustic system SAR and very high resolution seismic, completed by piston cores collected during the CADISAR cruise allow to improve the understanding of the hydrodynamics of the MOW in the eastern part of the Gulf of Cadiz. Interpretation of data corrects the previous model established in this area and allows, for the first time, the accurate characterization of various bedforms and erosive structures along the MOW pathway and the precise identification of numerous gravity instabilities. The interaction between the MOW, the seafloor morphology and the Coriolis force is presently the driving force of the sedimentary distribution pattern observed on the Gulf of Cadiz continental slope. (C) 2007 Elsevier B.V. All rights reserved.

(Marine Geology. vol. 246, n° 0025-3227, pp. 42-59, 01/11/2007)

EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS

Low-latitude "dusty events" vs. high-latitude "icy Heinrich events

Elsa Julien, Francis Grousset, Bruno Malaize, Josette Duprat, Maria Fernanda Sanchez Goni, Frédérique Eynaud, Karine Charlier, Ralph Schneider, Aloys Bory, Viviane Bout, Jose-Abel Flores

It has been proposed that tropical events could have participated in the triggering of the classic, high-latitude, iceberg-discharge Heinrich events (HE). We explore low-latitude Heinrich events equivalents at high resolution, in a piston core recovered from the tropical north-western African margin. They are characterized by an increase of total dust, lacustrine diatoms and fibrous lacustrine clay minerals. Thus, low-latitude events clearly reflect severe aridity events that occurred over Africa at the Saharan latitudes, probably induced by southward shifts of the Inter Tropical Convergence Zone. At a first approximation, it seems that there is more likely synchronicity between the high-latitude Heinrich Events (HEs) and low-latitude events (LLE), rather than asynchronous behaviours.

(Quaternary Research. vol. 68, n° 0033-5894, pp. 379-386, 01/11/2007)

EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS, PBDS, INSU - CNRS, CNRS