Publications

Publications

Publications

Publications

Publications

Publications

Publications

Publications

Biosurveillance de la pollution de la lagune de Bizerte (Tunisie) par l’analyse comparée des niveaux de contamination et de l’écotoxicité des sédiments et du biote

Badreddine Barhoumi

L’objectif de cette thèse est le diagnostic de l’état de santé de la lagune de Bizerte par une approche multi-marqueurs (chimique, biochimique et morphométrique) et multi-compartiments (sédiment et biote). Pour atteindre cet objectif, les modèles biologiques choisis sont la moule Mytilus galloprovincialis et le poisson gobie Zosterisessor ophiocephalus. Ces deux espèces sont largement répandues dans la lagune de Bizerte et la mer Méditerranée. Dans une première partie et afin d’estimer les niveaux de contamination de la lagune de Bizerte par les polluants organiques persistants (POPs), des analyses chimiques, granulométriques et minéralogiques (COT) de sédiments superficiels ont été réalisées. Par la suite la toxicité potentielle des sédiments a été évaluée par une batterie de bioessais. Dans une troisième partie la biodisponibilité et l’impact écotoxicologique des POPs étudiés ont été évalués par l’accumulation de ces contaminants au niveau des deux organismes indicateurs choisis et l’étude des réponses biologiques associées à travers quelques biomarqueurs tels que la catalase (CAT), l’acide thiobarbiturique (TBARS); l’Ethoxyrésorufine O-dééthylase (EROD); la glutathion-S-transférase (GST) et l'acétylcholinestérase (AChE). Les principaux résultats des analyses chimiques révèlent une contamination générale des sédiments et organismes étudiés par les POPs. Les niveaux de contamination sont fonction de l’espèce et de la station étudiée. La comparaison de nos valeurs avec les données de la littérature a montré que les niveaux de contamination de la lagune sont similaires ou légèrement inférieurs à ceux enregistrés dans des écosystèmes équivalents dans d’autres pays du monde. L’estimation de la toxicité des sédiments au moyen des valeurs guides sédimentaires (ERL, ERM, TEL et PEL) et trois tests biologiques (Microtox®, SOS-Chromotest® et test MELA) ont montré que les sédiments des stations du canal de Bizerte S1 et S3 représentent un danger accru pour les organismes aquatiques. Nos résultats ont montré que les biomarqueurs mesurés chez les deux espèces choisies sont des paramètres sensibles et inductibles permettant de qualifier l’état de santé des organismes et la qualité globale du milieu étudié. Les marqueurs morphométriques contrairement aux marqueurs biochimiques n’ont pas permis de discriminer les différents sites étudiés. Contrairement aux poissons, il a été démontré chez les moules que les facteurs abiotiques ont une influence sur les concentrations en POPs et les réponses des biomarqueurs.Au vu de l’ensemble de ces résultats, il apparaît que cette approche intégrative associant des mesures chimiques et écotoxicologiques représente un bon moyen pour évaluer la qualité de l’environnement notamment dans le cadre de programmes de biosurveillance.

(10/06/2014)

EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS

La sédimentation dans le Golfe de Cadix au cours des derniers 50 000 ans (analyses multi-paramètres et multi-échelles).

Rim Hassan

La sédimentation dans le Golfe de Cadix, de Gibraltar au Cap Saint-Vincent, est soumise à la circulation d’un flux permanent d’eau profonde venant de la Méditerranée connu sous le nom de Veine d’Eau Méditerranéenne ou VEM. Cette eau plus chaude, plus salée et plus dense que les eaux atlantiques s’écoule sur les marges espagnole et portugaise avec un débit moyen aussi important queplusieurs fleuves du globe. Ce courant de fond entraîne le transport et le remaniement des particules déjà déposées sur le fond. L’étude biostratigraphique détaillée à partir du sens d’enroulement de l’espèce de foraminifère planctonique Globorotalia truncatulinoides, de l’espèce polaire Neogloquadrina pachyderma senestre et du ptéropode Limacina retroversa calibrée par de nombreuses datations 14C AMS et des analyses isotopiques a permis de corréler les carottes. Les variations des processus sédimentaires dans le temps et dans l’espace montrent l’influence du climat sur les variations des taux de sédimentation et la granularité des dépôts. Ainsi, deux périodes de moindre activité de la VEM se situent pendant le Bølling-Alleröd et l’Holocène inférieur. Le Younger Dryas traduit au contraire une période de forte circulation de la VEM. De nombreux hiatus sédimentaires et dépôts gravitaires (glissements, turbidites) traduisent une instabilité sédimentaire liée à la fréquence des tremblements de terre qui se produisent dans le Golfe de Cadix et dans les régions adjacentes. Huit types de traces fossiles ont été reconnus (Chondrites, Diplocraterion, Nereites, Paleophycus, Phycosiphon, Thalassinoides, Zoophycos, des filaments (Trichichnus et Mycelia) et des traces restent indéterminées. Les traces fossiles de Zoophycos et de Paleophycus pendant le LGM traduisent la présence de circulations de masses d’eaux riches en oxygène au niveau du fond. Ces traces fossiles de Zoophycos sont visibles du LGM à l’Holocène inférieur au niveau du chenal-levée de Tasyo.

(10/06/2014)

EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS

Assessment of Reactivity and Mobility of MTE in Surface Sediments in Morbihan Coast (South Brittany, France)

Joselyn Jimenez, Evelyne Goubert, Laurent Labeyrie, Alexandra Coynel, David Menier

(08/06/2014)

LGO, UBS, IFREMER, UBO EPE, CNRS, GEOARCHI, UBS, UBO EPE, IBSHS, UBO EPE, EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS, LDO, INSU - CNRS, UBO EPE, CNRS

Oxidative stress in relation to reproduction, contaminants, gender and age in a long-lived seabird

David Costantini, Alizée Meillère, Alice Carravieri, Vincent Lecomte, Gabriele Sorci, Bruno Faivre, Henri Weimerskirch, Paco Bustamante, Pierre Labadie, Hélène Budzinski, Olivier Chastel

Reproduction is a demanding activity for animals, since they must produce, and in some cases protect and provision, their young. It is often overlooked that demands of reproduction may also be exacerbated by exposure to contaminants. In this study, we make use of an exceptional long-term dataset to perform a cross-sectional study on the long-lived wandering albatross (Diomedea exulans) in order to test the effects of reproduction, persistent organic pollutants [POPs: pesticides and polychlorinated biphenyls (PCBs)], mercury, individual age (3–47 years), and sex on the levels of plasma oxidative damage and inflammation. The results of our study support the hypothesis that oxidative damage may be a physiological cost of reproduction and that individuals carrying higher levels of organic or non-organic contaminants have higher oxidative damage. Levels of the inflammatory protein haptoglobin were similar between breeding and nonbreeding birds, with the exception of breeding males which had the lowest levels of haptoglobin. Our data also show an effect of age and of organic contaminants on the plasma oxidative damage level, but not on plasma haptoglobin. In addition, plasma oxidative damage level increased with red blood cell mercury concentration in females but not in males. Hence, our study highlights that the harmful effects of contaminants may come through interaction with factors like life stage or gender, suggesting potential for high variation in susceptibility to contamination among individuals.

(Oecologia. vol. 175, n° 0029-8549, pp. 1107 - 1116, 04/06/2014)

CEBC, INRA, ULR, CNRS, LIENSs, INSU - CNRS, ULR, CNRS, BGS, UB, CNRS, EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS

Recent sediment transport and deposition in the Cap-Ferret Canyon, South-East margin of Bay of Biscay

Sabine Schmidt, Hélène Howa, Amy Diallo, Jacobo Martín, Michel Cremer, Pauline Duros, Christophe Fontanier, Bruno Deflandre, Édouard Metzger, Thierry Mulder

The Cap-Ferret Canyon (CFC), a major morphologic feature of the eastern margin of the Bay of Biscay, occupies a deep structural depression that opens about 60 km southwest of the Gironde Estuary. Detailed depth profiles of the particle-reactive radionuclides 234Th and 210Pb in interface sediments were used to characterise the present sedimentation (bioturbation, sediment mass accumulation, and focusing) in the CFC region. Two bathymetric transects were sampled along the CFC axis and the southern adjacent margin. Particle fluxes were recorded from the nearby Landes Plateau by means of sediment traps in 2006 and 2007. This dataset provides a new and comprehensive view of particulate matter transfer in the Cap-Ferret Canyon region, through a direct comparison of the canyon with the adjacent southern margin. Radionuclide profiles (234Th and 210Pb) and mass fluxes demonstrate that significant particle dynamics occur on the SE Aquitanian margin in comparison with nearby margins. The results also suggest show three distinct areas in terms of sedimentary activity. In the upper canyon (<500 m), there is little net sediment accumulation, suggesting a by-pass area. Sediment focusing is apparent at the middle canyon (500–1500 m), that therefore acts as a depocenter for particles from the shelf and the upper canyon. The lower canyon (>2000 m) can be considered inactive at annual or decadal scales. In contrast with the slow and continuous accumulation of relatively fresh material that characterises the middle canyon, the lower canyon receives pulses of sediment via gravity flows on longer time scales. At decadal scale, the CFC can be considered as a relatively quiescent canyon. The disconnection of the CFC from major sources of sediment delivery seems to limit its efficiency in particle transfer from coastal areas to the adjacent ocean basin.

(Deep Sea Research Part II: Topical Studies in Oceanography. vol. 104, n° 0967-0645, pp. 134-144, 01/06/2014)

EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS, BIAF, UA, ICM, CSIC, JAMSTEC, IFREMER, LPG-ANGERS, LPG, UA, UN UFR ST, UN, INSU - CNRS, CNRS, INPL

Benthic foraminiferal thanatocoenoses from the Cap-Ferret Canyon area (NE Atlantic): A complex interplay between hydro-sedimentary and biological processes

P. Duros, F.J. Jorissen, F. Cesbron, S. Zaragosi, S. Schmidt, E. Metzger, C. Fontanier

(Deep Sea Research Part II: Topical Studies in Oceanography. vol. 104, n° 0967-0645, pp. 145-163, 01/06/2014)

BIAF, UA, MIO, IRD, AMU, INSU - CNRS, UTLN, CNRS, EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS, LPG-ANGERS, LPG, UA, UN UFR ST, UN, INSU - CNRS, CNRS

Effet de pesticides sur les micro-algues du continuum eau douce-eau marine : Influence de la matière organique dissoute naturelle ?

V. Dupraz, N. Coquillé, E. Parlanti, Soizic Morin, S. Stachowski Haberkorn, Y. Guo, L. Haugarreau, D. Menard, Julien Rouxel, I. Auby, D. Maurer, C. Barbier-Méteignier, L. Rigouin, M. Rumebe, Nicolas Mazzella, Mélissa Eon, Aurélie Moreira, G. Jan, H. Budzinski, Patrick Mazellier, N. Geneste, M.-H. Devier, Patrick Pardon, K. Lemenach, S. Augagneur, L. Peluhet

Le poster résume les principaux objectifs des projets AAP COTE IMPACT et EC2CO COMPACT. Les projets IMPACT et COMPACT constituent une approche originale combinant : du réalisme écologique, par la prise en compte des réponses au niveau spécifique mais également au niveau des communautés naturelles ; du réalisme environnemental, en considérant l'effet d'herbicides seuls et en mélange, en interaction avec la matière organique dissoute naturelle. Ces projets permettront d'améliorer les connaissances sur les effets du S-métolachlore, un herbicide aux effets peu documentés mais pourtant très utilisé et retrouvé fréquemment en eaux côtières (Bassin d'Arcachon, estuaire de la Charente).

(pp. 1, 21/05/2014)

IFREMER, UR EABX, IRSTEA, EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS

New records of Spio symphyta and Spio martinensis (‘Polychaeta’: Canalipalpata: Spionidae) from Arcachon Bay (France), NE Atlantic

Nicolas Lavesque, Paulo Bonifacio, Karin Meissner, Hugues Blanchet, Benoit Gouillieux, Sophie Dubois, Guy Bachelet

This paper presents new records of Spio symphyta Meißner et al., 2011 and Spio martinensis Mesnil, 1896 (‘Polychaeta’: Canalipalpata: Spionidae) from Arcachon Bay (southern Bay of Biscay). For both species the new records represent an extension of their known distributional range. The two species have probably been present in Arcachon Bay for several years but were confused with other species of the genus Spio. Spio symphyta was identified at five locations in Arcachon Bay in 2009 and 2013 and S. martinensis at three stations in 2012 and 2013. A detailed and illustrated description of specimens from Arcachon Bay is provided. Important characters of Spio spp. occurring in the area are compared.

(Marine Biodiversity. vol. 45, n° 1867-1616, pp. 77-86, 17/05/2014)

EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS, LMU

Upwind Stabilized Finite Element Modelling of Non-hydrostatic Wave Breaking and Run-up

Paola Bacigaluppi, Mario Ricchiuto, Philippe Bonneton

In the following report a new methodology is presented to model the propagation, wave breaking and run-up of waves in coastal zones. We represent the different coastal phenomena through the coupling of non-linear shallow water equations with the extended Boussinesq equations of Madsen and Sørensen. Each of the involved equations has a major role in describing a particular physical behaviour of the wave: the latter equations permit to model the propagation, while the non-linear shallow water ones lead waves to locally converge into discontinuities. We start from the third-order stabilized finite element scheme for the Boussinesq equations, developed in a previous scientific work (Ricchiuto and Filippini, J.Comput.Phys. 2014) and develop a non-linear variant, and detach the dispersive from the shallow water terms. A shock-capturing technique based on local non-linear mass lumping that permits in the shallow water regions to degrade locally the scheme to a first-order one across bores (shocks) and dry fronts is proposed. As for the detection of the breaking fronts, the shallow water areas, this involves physics based breaking criteria. We present different definitions of the breaking criterion, including a local implementation of the convective criterion of (Bjørkavåg and H. Kalisch, Phys.Letters A 2011), and the hybrid models of (Kazolea et. al, J.Comput.Phys. 2014), and (Tonelli and Petti, J.Hydr.Res. 2011). The behavior of different breaking criteria is investigated on several cases for which experimental data are available.

(12/05/2014)

BACCHUS, Inria, UB, CNRS, IMB, UB, Bordeaux INP, CNRS, EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS

First record of Naineris setosa (Verrill, 1900) (Annelida: Polychaeta: Orbiniidae) in the Western Mediterranean Sea

Nicolas Lavesque, Paulo Bonifacio, Inès Khedhri, Hanem Djabou, Ahmed Afli

The Polychaeta Naineris setosa (Verrill, 1900) is reported for the first time in the Western Mediterranen Sea. Several specimens were collected in 2012 and 2013 in Boughrara Lagoon (Tunisia). The vector of introduction of N. setosa likely commercial shipping because Gabes is an international harbour with dense shipping traffic. A detailed description of specimens from Boughrara Lagoon is provided in this paper.

(BioInvasions Records. vol. 3, n° 2242-1300, pp. 83-88, 12/05/2014)

EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS