Molecular and phenotypic responses of Japanese medaka (Oryzias latipes) early life stages to environmental concentrations of cadmium in sediment
Japanese medaka embryos were exposed to environmental concentrations of cadmium (Cd) to investigate adverse and adaptive responses in fish early life stages. Embryos were exposed during their whole development by static sediment-contact to environmental Cd concentrations (2 and 20 μg/g dry weight). Cd bioaccumulation, developmental defects, biochemical and biomolecular (qRT-PCR) responses were analyzed in embryos and hatchlings. A dose-dependent increase of Cd bioaccumulation and developmental defects was observed at hatching. Cd had clear impacts on heartbeat and cardiac morphogenesis and also induced to spinal deformities. The profile and the level of gene transcription were differentially modulated according to the Cd concentration, the duration of exposure and/or the developmental stage of fish. Pro-apoptotic bax and DNA repair rad51 transcripts were significantly repressed in embryos exposed to the highest Cd concentration. Repression of these genes was correlated to the increase of heart rate in 6-day-old embryos. NADH-dehydrogenase nd5 gene transcription was inhibited in larvae at the lowest concentration suggesting mitochondrial respiratory chain impairment, in association with Cd-induced teratogenicity. Finally, wnt1 gene was overexpressed indicating putative deregulation of Wnt signaling pathway, and suggested to be implied in the occurrence of some spinal and cardiac deformities. Results of this study permitted to propose some promising markers at the transcriptional and phenotypical level, responding to environmental concentrations of Cd. The present work also highlights the usefulness of the modified version of the medaka embryo-larval assay with sediment-contact exposure (MELAc) to investigate the toxicity and the modes of action of sediment-bound pollutants.
(Environmental Science and Pollution Research. vol. 23, n° 0944-1344, pp. 17969-17981, 25/04/2026)
SEBIO, INERIS, URCA, ULH, NU, URCA, CNRS, EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS
DYNALIT : Dynamique du Littoral et Trait de Côte
Le littoral, caractérisé par une grande diversitéd’environnements (plages sableuses ou rocheuses, cordonsdunaires, falaises, lagunes, estuaires...) est une zone très mobile etévolutive du fait de forçages hydrodynamiques et météorologiquessouvent intenses. Cet environnement est fragile, car soumis àl’impact d’activités humaines qui ne cessent d’augmenter (urbanisation,aménagements...), mais aussi aux effets du changementclimatique (élévation du niveau de la mer, modification durégime de houles, inondations). Comprendre le fonctionnementhydromorpho-sédimentaire des environnements littoraux est crucialpour prédire leur évolution et celle des écosystèmes associés.Le Service National d’Observation labellisé par le CNRS, (SNO)DYNALIT, - Dynamique du Littoral et du Trait de Côte a pourbut de constituer une base de données hydromorphologiques sur lelong terme de 29 sites ateliers représentatifs des environnementslittoraux français (côtes sableuses, falaises et embouchures) afin :- De mesurer la cinématique de ces environnements et du trait decôte associé ;- De mieux comprendre les interactions entre les processushydrodynamiques-transport sédimentaires-réponse morphologiqueassociés à la dynamique du littoral ;- Utiliser les observations pour améliorer notre connaissance desréponses de la morphologie des littoraux dans différents contextesde forçages météo-marins ;- D’utiliser ces observations pour analyser l’importance relativedes facteurs anthropiques et naturels sur la dynamique littorale ;- De se positionner en interlocuteur pour les responsables de ladéfinition et la mise en oeuvre des politiques de gestion des risqueslittoraux.
(pp. 84, 25/04/2026)
LDO, INSU - CNRS, UBO EPE, CNRS, LETG - Nantes, UNICAEN, NU, EPHE, PSL, UBO EPE, UR2, CNRS, IGARUN, UN, INSU - CNRS, UM, CNRS, UA, LIENSs, INSU - CNRS, ULR, CNRS, LETG - Caen, LETG, UNICAEN, NU, UA, EPHE, PSL, UBO EPE, UR2, CNRS, IGARUN, UN, LOMC, ULH, NU, CNRS, LOG, INSU - CNRS, ULCO, CNRS, IRD [Ile-de-France], ULCO, M2C, UNICAEN, NU, INSU - CNRS, UNIROUEN, NU, CNRS, GR, UR, INSU - CNRS, CNRS, Cerema Equipe-projet HA, Cerema, UPPA, LPG-ANGERS, LPG, UA, UN UFR ST, UN, INSU - CNRS, CNRS, IRD, UPVD, AU, UR, UM, UG, UA, GET, IRD, UT3, Comue de Toulouse, INSU - CNRS, CNES, CNRS, CEREGE, IRD, INRA, AMU, CdF (institution), INSU - CNRS, CNRS, EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS, LETG - Brest, LETG, UNICAEN, NU, UA, EPHE, PSL, UBO EPE, UR2, CNRS, IGARUN, UN
Improving past sea surface temperature reconstructions from the Southern Hemisphere oceans using planktonic foraminiferal census data
We present an improved database of planktonic foraminiferal census counts from the Southern Hemisphere oceans (SHO) from 15°S to 64°S. The SHO database combines three existing databases. Using this SHO database, we investigated dissolution biases that might affect faunal census counts. We suggest a depth/ math formula threshold of ~3800 m/ math formula = ~ −10 to −5 µmol/kg for the Pacific and Indian Oceans and ~4000 m/ math formula = ~0 to 10 µmol/kg for the Atlantic Ocean, under which core-top assemblages can be affected by dissolution and are less reliable for paleo-sea surface temperature (SST) reconstructions. We removed all core tops beyond these thresholds from the SHO database. This database has 598 core tops and is able to reconstruct past SST variations from 2° to 25.5°C, with a root mean square error of 1.00°C, for annual temperatures. To inspect how dissolution affects SST reconstruction quality, we tested the data base with two “leave-one-out” tests, with and without the deep core tops. We used this database to reconstruct summer SST (SSST) over the last 20 ka, using the Modern Analog Technique method, on the Southeast Pacific core MD07-3100. This was compared to the SSST reconstructed using the three databases used to compile the SHO database, thus showing that the reconstruction using the SHO database is more reliable, as its dissimilarity values are the lowest. The most important aspect here is the importance of a bias-free, geographic-rich database. We leave this data set open-ended to future additions; the new core tops must be carefully selected, with their chronological frameworks, and evidence of dissolution assessed.
(Paleoceanography. vol. 31, n° 0883-8305, pp. 822-837 (IF 3,738), 25/04/2026)
LSCE, UVSQ, INSU - CNRS, CNRS, DRF (CEA), CEA, GEOPS, UP11, CNRS, PALEOCEAN, LSCE, UVSQ, INSU - CNRS, CNRS, DRF (CEA), CEA, EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS, NIWA
Comment réduire l'impact des rejets urbains d'une agglomération sur le milieu récepteur ? Retours sur les résultats du programme Etiage et sur la prise en compte progressive de la qualité dans le mode de gestion de Bordeaux Métropole
Pour répondre aux ambitions de Bordeaux Métropole et l'accompagner dans la reconquête d'un état écologique acceptable de l'estuaire, un consortium s'est formé autour du programme Etiage. Ce programme a permis d'expliciter les facteurs responsables de la qualité biogéochimique de la Gironde.
(TSM. Techniques Sciences Méthodes – Génie urbain, génie rural, n° 0299-7258, pp. 79-97, 25/04/2026)
IRSTEA, EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS, UR EABX, IRSTEA, IRSTEA
Sea surface temperature variability in the North Western Mediterranean Sea (Gulf of Lion) during the Common Era
This study investigates the multidecadal-scale variability of sea surface temperatures (SSTs) in the convection region of the Gulf of Lion (NW Mediterranean Sea) over the full past 2000 yr (Common Era) using alkenone biomarkers. Our data show colder SSTs by 1.7 °C over most of the first millennium (200–800 AD) and by 1.3 °C during the Little Ice Age (LIA; 1400–1850 AD) than the 20th century mean (17.9 °C). Although on average warmer, those of the Medieval Climate Anomaly (MCA) (1000–1200 AD) were lower by 1 °C. We found a mean SST warming of 2 °C/100 yr over the last century in close agreement with the 0.22 and 0.26 °C/decade values calculated for the western Mediterranean Sea from in situ and satellite data, respectively. Our results also reveal strongly fluctuating SSTs characterized by cold extremes followed by abrupt warming during the LIA. We suggest that the coldest decades of the LIA were likely caused by prevailing negative EA states and associated anticyclone blocking over the North Atlantic resulting in cold continental northeasterly winds to blow over Western Europe and the Mediterranean region.
(Earth and Planetary Science Letters. vol. 456, n° 0012-821X, pp. 124-133, 25/04/2026)
BTP, LOCEAN, IPSL, ENS-PSL, UVSQ, UPMC, CEA, INSU - CNRS, X, CNES, CNRS, MNHN, IRD, UPMC, INSU - CNRS, CNRS, LOCEAN, IPSL, ENS-PSL, PSL, UVSQ, UPMC, CEA, INSU - CNRS, X, IP Paris, CNES, CNRS, MNHN, IRD, UPMC, INSU - CNRS, CNRS, CSIC, EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS, CEFREM, UPVD, INSU - CNRS, CNRS
Relation entre hypoxie, émissions de GES et force du vent dans les herbiers denses d’hydrophytes dans les lacs
L’impact de deux hydrophytes exotiques, Lagarosiphon major et Egeria densa, sur la biogéochimie d’un lac tempéré peu profond (lac de Lacanau - Aquitaine, SO France) a été étudié pendant 3 ans (2013-2015). Les résultats montrent qu’une biomasse élevée de plantes favorise la stratification de la colonne d’eau et l’accumulation de la matière organique, avec des rétroactions positives sur les processus de respiration anaérobie. En même temps, la canopée des plantes semble agir comme un filtre, en favorisant l’oxydation du méthane rejeté à l’interface sédiment-eau. Au contraire, lors des fréquents évènements de brassage dus au vent, quand la colonne d’eau est mélangée et entièrement oxygénée, le méthane est probablement rapidement émis vers l’atmosphère. Cette étude montre qu’il existe une interaction non négligeable entre l’hydrodynamique, l’écophysiologie des plantes et le cycle du carbone. Des recherches supplémentaires sur ces processus sont donc nécessaires dans le contexte des changements globaux que subissent ces lacs.
(pp. 15, 25/04/2026)
UR EABX, IRSTEA, EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS
The French initiative for scientific cores virtual curating : a user-orientedintegrated approach
Managing scientific data is probably one the most challenging issue in modern science. The question is made evenmore sensitive with the need of preserving and managing high value fragile geological sam-ples: cores. Largeinternational scientific programs, such as IODP or ICDP are leading an intense effort to solve this problem andpropose detailed high standard work- and dataflows thorough core handling and curating. However most resultsderived from rather small-scale research programs in which data and sample management is generally managedonly locally – when it is . . .The national excellence equipment program (Equipex) CLIMCOR aims at developing French facilities for coringand drilling investigations. It concerns indiscriminately ice, marine and continental samples. As part of this initiative,we initiated a reflexion about core curating and associated coring-data management. The aim of the project isto conserve all metadata from fieldwork in an integrated cyber-environment which will evolve toward laboratoryacquireddata storage in a near future. In that aim, our demarche was conducted through an close relationship withfield operators as well laboratory core curators in order to propose user-oriented solutions.The national core curating initiative currently proposes a single web portal in which all scientifics teams can storetheir field data. For legacy samples, this will requires the establishment of a dedicated core lists with associatedmetadata. For forthcoming samples, we propose a mobile application, under Android environment to capture technicaland scientific metadata on the field. This application is linked with a unique coring tools library and is adaptedto most coring devices (gravity, drilling, percussion, etc...) including multiple sections and holes coring operations.Those field data can be uploaded automatically to the national portal, but also referenced through internationalstandards or persistent identifiers (IGSN, ORCID and INSPIRE) and displayed in international portals (currently,NOAA’s IMLGS).In this paper, we present the architecture of the integrated system, future perspectives and the approach we adoptedto reach our goals. We will also present in front of our poster, one of the three mobile applications, dedicated moreparticularly to the operations of continental drillings.
(25/04/2026)
EDYTEM, USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry], CNRS, Fédération OSUG, DTI, INSU - CNRS, CNRS, ISTerre, IFSTTAR, INSU - CNRS, USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry], CNRS, UGA [2016-2019], EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS, LGGE, INSU - CNRS, CNRS, OSUG, Grenoble INP, INSU - CNRS, IRSTEA, USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry], CNRS, UGA [2016-2019], EMBS, iSTeP, UPMC, CNRS, IRSI, IFREMER, INSU - CNRS
Potential of Video Cameras in Assessing Event and Seasonal Coastline Behaviour: Grand Popo, Benin (Gulf of Guinea)
In this study, we explore the potential of a nearshore video system to obtain a long-term estimation of coastal variables (shoreline, beach slope, sea level elevation and wave forcing) at Grand Popo beach, Benin, West Africa, from March 2013 to February 2015. We first present a validation of the video system with field data over a 10-day experiment conducted on Grand Popo beach in 2014. Secondly, 2-years daily and monthly timeseries are extracted and their variability is described as a function of regional forcing and climatic modes. All variables show large monthly variability. The longshore sediment transport estimated locally from video is in agreement with that derived from Era-Interim wave data re-analyses. Results show that the shoreline responds predominantly to tides at the event scale and to waves. Overall, this study suggests that video stations are efficient tools to monitor coastal processes over the long term, in complement with other conventional approaches. Although no clear conclusions can be drawn on inter-annual variability, the results show that it is important to build up extended coastal observation networks to address coastline changes over a wide range of scales.
(Journal of Coastal Research, n° 0749-0208, pp. 442-446, 25/04/2026)
ECOLA, LEGOS, IRD, UT3, Comue de Toulouse, INSU - CNRS, CNES, CNRS, OLVAC, LEGOS, IRD, UT3, Comue de Toulouse, INSU - CNRS, CNES, CNRS, CICESE, EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS, AOS Program, GFDL, NOAA, LEGOS, IRD, UT3, Comue de Toulouse, INSU - CNRS, CNES, CNRS, CEREGE, IRD, INRA, AMU, CdF (institution), INSU - CNRS, CNRS
Dynamics of particulate organic matter in a coastal system characterized by the occurrence of marine mucilage – A stable isotope study
In coastal systems, particulate organic matter (POM) originates from various autochthonous and allochthonous organic matter sources. Also, some coastal systems are characterized by the occurrence of large amounts of mucilaginous material of biologic origin (i.e. phytoplankton, bacteria), which aggregates and potentially traps other organisms and particles present in the water column. This study focuses on POM origin and spatio-temporal dynamics in the South-East coast of the Bay of Biscay, an area subject to mucilage occurrence. In order to investigate POM quantitative and qualitative (C and N elemental and isotopic ratios) characteristics, sampling was performed over an annual cycle at two sites experiencing different mucilage occurrence and river influence. Contribution of phytoplankton, terrestrial POM and anthropogenic POM to coastal-POM composition was calculated using a three-sources mixing model. Overall, phytoplankton dominated the coastal-POM composition at all seasons, sites and most of the depths (71.6 ± 24.2%). Terrestrial-POM contribution was moderate (22.7 ± 21.8%) and anthropogenic-POM contribution was usually negligible (5.7 ± 7.4%). Both sites mainly exhibited similar vertical and temporal variations in terms of POM origin and dynamics: terrestrial-POM contribution increased with depth and was higher in winter at all depths and in autumn in bottom waters, compared to other seasons. The main differences between both sites were related to the vertical dynamics of the terrestrial contribution to the coastal POM. Horizontal, vertical and temporal variation of POM composition was linked to processes driving the sedimentary hydrodynamics: the river flow, the direction of the river plume and events of sediment resuspension/deposition. During the study period, the mucilage occurred only as flocs (small aggregates). The mucilage was of autochthonous origin and did not trap detectable amount of allochthonous material. © 2016 Elsevier B.V.
(Journal of Sea Research (JSR). vol. 116, n° 1385-1101, pp. 12--22, 25/04/2026)
LPCNO, INSA Toulouse, INSA, Comue de Toulouse, ICT, IRD, UT3, Comue de Toulouse, INC-CNRS, CNRS, Toulouse INP, Comue de Toulouse, IRSAMC, UT3, Comue de Toulouse, CNRS, EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS, IPREM, UPPA, INC-CNRS, CNRS, VUB
Transfert de composés per- et poly-fluorés du sédiment au poisson
Dans le contexte du Plan d’actions sur les polychlorobiphényles, des composés per- et polyfluorés ont fait l’objet d’analyses dans la chair des poissons, montrant un accroissement notable des concentrations de plusieurs PFAS à l’aval de Lyon. Les PFAS, composés très persistants, ont un comportement différent des micropolluants hydrophobes « classiques », justifiant de chercher à mieux comprendre leur devenir et leurs voies de transfert dans les réseaux trophiques, le rôle du sédiment dans ce devenir, et les facteurs contrôlant l’accumulation par les organismes. La présente étude visait à mieux comprendre le devenir des PFAS dans le Rhône, et plus précisément de documenter les cinétiques d’accumulation de quelques composés perfluorés pour deux espèces d’invertébrés benthiques (larves de chironome, Chironomus riparius, et gammares, Gammarus spp.), d’évaluer le rôle du sédiment dans le processus d’accumulation, et de reconstituer l’historique de la contamination sur un site à l’aval de Lyon (lône de l’Ile du Beurre) à l’aide d’une carotte de sédiment. Un profil temporel et spatial de la contamination des sédiments a été établi, la contamination de trois espèces de poissons (barbeau fluviatile, Barbus barbus, gardon, Rutilus rutilus, et goujon, Gobio gobio) et de leurs proies par une gamme d’une vingtaine de PFAS a été déterminée, et des essais d’accumulation de ces PFAS au laboratoire à partir du sédiment de l’Ile du Beurre ont été réalisés avec des larves de chironomes et des gammares. Le gardon est généralement moins contaminé que les deux autres espèces, sauf pour l’acide perfluorooctane sulfonique (PFOS). Le barbeau est en général plus contaminé que le goujon, sauf pour le PFOS, le perfluorooctanoate (PFOA), le perfluorodécane sulfonate (PFDS) et l’acide 6:2 fluorotélomère sulfonique (6:2FTSA). L’influence de la taille (proxy de l’âge) sur l’accumulation des composés dominants dans les sédiments de l’Ile du Beurre (acides perfluoroundécanoïque - PFUnDA et perfluorotridécanoïque PFTrDA) n’a pas été mise en évidence. En revanche, pour le PFOS et le PFNA (acide perfluorononanoïque), les barbeaux juvéniles sont plus contaminés que les individus plus gros et plus âgés, ce qui suggère une moindre capacité à les éliminer chez les juvéniles. Le contenu stomacal des barbeaux comprend une forte proportion de gammares, celui des goujons est dominé par les chironomes, ce qui contribue à expliquer les différences de contamination entre espèces. Deux types d’indicateur de bioamplification ont été testés, facteur de bioamplification (BMF) ajusté au niveau trophique pour des couples prédateur-proie constitués de barbeaugammares et goujon-chironomes, et des facteurs d’amplification trophique (TMF), déterminés pour le réseau trophique du barbeau. PFUnDA, PFDoDA (acide perfluorododécanoïque), le PFTrDA, PFOS et FOSA (perfluorooctane sulfonamide) sont clairement bioamplifiés chez le barbeau. Chez le goujon, les mêmes composés, plus PFOA, PFNA, PFHxS (acide perfluorohexane sulfonique) et PFDS sont également bioamplifiés. Les BMF tendent à augmenter quand le nombre de carbones perfluorés des composés augmente. Lors de tests en laboratoire, l’accumulation et l’élimination des PFAS du sédiment de l’Ile du Beurre sont rapides chez le chironome, et plus lentes chez le gammare où l’état stable n’était pas atteint en 21 jours. L’hypothèse d’une dépendance à la concentration, ou transport actif de ces composés lors de l’accumulation, a également été examinée chez le chironome à l’aide d’un test sur sédiment enrichi. Si ce mécanisme ne peut être exclu pour le PFTrDA, il n’explique pas mieux l’accumulation que la diffusion simple. L’accumulation, chez le chironome et le gammare, est plus importante pour les composés à longue chaîne perfluorée (C8), notamment en raison de cinétiques d’élimination plus lentes, notamment chez le gammare.
(pp. 75, 25/04/2026)
UR MALY, IRSTEA, UT, EAWAG, EPFL, EPOC, EPHE, PSL, UB, INSU - CNRS, CNRS, UNILIM