Biologie moléculaire

Plateforme Biologie moléculaire

Implantée sur le site d’Arcachon et adossée aux équipes EA et ECOBIOC, la plateforme Biologie moléculaire a pour mission de soutenir les recherches en environnement et plus particulièrement celles ayant pour objectif d’évaluer les impacts de l’activité humaine sur les écosystèmes aquatiques.

De part ses compétences scientifiques et techniques en biologie moléculaire, la plateforme intervient dans nombreux champs disciplinaires : taxonomie, génotypage, ADN environnemental, épigénétique et transcriptomique. La plateforme est accessible aux partenaires extérieurs (public ou privé) sur demande et propose des formations, la mise à disposition d’équipements, ainsi que des prestations de service.

Responsables

Fabien Pierron

Responsable scientifique

Fabien Pierron

 

Responsable technique

Guillemine Daffe

Applications / Expertises

Cascades

Taxonomie moléculaire / Génotypage

Identification moléculaire d’espèces à partir de gènes cibles (Espèce Non Indigène, espèces cryptiques).

Épigénétique et Transcriptomique

Étude de l’effet des facteurs environnementaux, notamment
des polluants, sur la méthylation de l’ADN et l’expression des gènes.

Cascades

Instruments

Fast prep 24

Fast-Prep 24 : broyeur à billes pour la lyse des échantillons biologiques

Maxwell : extracteur automatique ADN/ARN

Maxwells
Biotek synergie : spectrofluorimètre</p>
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BioTek synergy : spectrofluorimètre

 

Qiavac : pompe à vide pour extraction ADN/ARN

 

Qiavac
Centrifugeuse réfrigérée

Centrifugeuse réfrigérée

 

Lecteur de gel d’agarose

 

Lecteur de gel d'agarose
QIAxcel

QIAxcel : électrophorèse capillaire

 

Light Cycler Roche 480 : PCR quantitative en temps réel

 

Light Cycler Roche 480
Pyromark Q48

Pyromark Q48 : Pyroséquenceur dévolu à l’analyse et à la quantification de la méthylation de l’ADN, mutation et SNP

Personnels impliqués